Начну с того, что переход в органику в мультсериале встречается крайне редко, и, видимо, не зря.

Следует признать, что режим органики подразумевает ряд положительных черт:

1. Экономия стройматериалов для построения мест жительства.
2. Удобно для быстрой и незаметной переброски войск.
3. Человеческую еду добыть проще, чем энергон (меньше нужно), тем более она обладает всяко большим вкусовым разнообразием.
4. Удобно для маскировки на планетах, заселенных людьми (органика не бросается в глаза в отличие машины без водителя).

Но вместе с тем, она несет и ряд отрицательных моментов:

1. Многократно увеличивается уязвимость.
2. Не исключена подверженность человеческим болезням.
3. Необходимость поддержания давления и определенного процента содержания кислорода.
4. Проблема устроения мест общего пользования на базах.
5. Необходимость существования развитых легкой и пищевой промышленностей.
6. Трудно представить себе Смертоносца, стирающего и гладящего свою одежду (значит, это должны были бы делать провинившиеся (Нетопырь?) или должны быть прачечные).
7. Надо где-то деньги брать (не банки же грабить!).
8. Если в корабль трансформеров, находящихся в органике, попадет шальная бомба? Тут уж кому повезет, но шансов выжить в такой ситуации маловато (можно либо не успеть перейти в механику, либо места для перехода не хватит).

Отсюда можно сделать вывод, что отрицательных черт гораздо больше, чем положительных. Следует также отметить, что возможность перехода в органику требовала бы развития множества отраслей промышленности и сельского хозяйства, если бы трансформеры не общались с людьми.